經(jīng)顱磁刺激的原理是應用磁場作用于大腦，產(chǎn)生生物電。生物電可以是抑制性，也可以是興奮性。所以根據(jù)原理，能治療的疾病種類比較多，不限制某一種。凡是產(chǎn)生興奮性的疾病，都可以用抑制性刺激來治療。 凡是腦抑制的疾病，都用興奮性的方法刺激，可以取得很好的療效。舉個例子，如帕金森病的主要表現(xiàn)是運動功能受到影響。患者有震顫，走路時啟動困難、慌張步態(tài)，這時可以用經(jīng)顱磁刺激作用于大腦運動皮層。 通常國內(nèi)會選擇抑制性刺激，當然國外有些中心會用興奮性刺激，總之改善了運動皮層的功能狀態(tài)，從而改善患者的步態(tài)困難。還有其他如常見的幻聽，耳鳴，用經(jīng)顱磁刺激也可以取得很好的療效，用抑制性刺激來減少耳鳴、幻聽。