臨床中進行無痛上消化道鏡或無痛下消化道鏡檢查，均采取全麻方式，經靜脈用藥麻醉全身。如普通胃鏡或腸鏡檢查則需進行局部麻醉，腸鏡檢查需提前清理糞便及腸內容物，需檢查前一天開始清理，達到腸道無食物、糞便、內容物通過的狀態(tài)。腸鏡及所有內窺鏡檢查前均需進行心電圖檢查及其他檢查，經全身評估符合該檢查要求情況下方可行無痛腸鏡。