胃腸道間質瘤較晚期患者會出現(xiàn)骨轉移。通常會出現(xiàn)在一些血供較豐富部位，如腰椎、肋骨骨轉移。通常出現(xiàn)骨轉移后患者主要表現(xiàn)為疼痛，如腰背部疼痛，這種疼痛為持續(xù)性的疼痛，不可自行緩解，而且有的時候會隨著體位改變加重疼痛。 出現(xiàn)骨轉移后治療以內(nèi)科靶向治療為主，有些患者可能會出現(xiàn)溶骨性改變。如果出現(xiàn)腰椎的溶骨性改變要特別重視，可能會出現(xiàn)壓縮性骨折，出現(xiàn)壓縮性骨折以后會擠壓脊柱、脊髓，出現(xiàn)截癱的情況。這些患者可能還要進行放療或骨保護劑治療，減緩腫瘤溶骨性改變，避免壓縮性骨折發(fā)生。