肝內膽管結石的時間對于治療方案不起決定作用，主要根據具體病情選擇治療方案。若結石較小，未造成膽道梗阻，肝功能正常，這時通常無需治療，平時適當注意生活方式，做到均衡膳食，少吃高膽固醇的食物，定期復查即可。若結石比較局限，引起膽道梗阻，這時可以考慮進行肝部分切除，徹底治療結石。若結石分布較廣，同時引起肝功異常，可以考慮通過經肝門部膽管，置入膽道鏡取石，一次取不干凈可以放置體管，以后可以通過體管竇道反復取石。若結石已造成嚴重的肝硬化、肝功能失代償，少數患者可能需要通過肝移植進行治療。因此肝內膽管結石的治療，需要結合患者的病情，制定個體化的治療方案，可以選擇包括取石、肝切除，甚至是肝移植的方式進行處理。