高位復(fù)雜性肛瘺一般采取手術(shù)治療，因?yàn)榉鞘中g(shù)治療沒什么效果。對于簡單的低位單純肛瘺會采取注射蛋白膠栓塞方法，成功率只有25%，一般不主張使用這種方法。 絕大多數(shù)肛瘺都需要手術(shù)治療，特別是高位復(fù)雜性肛瘺。雖然手術(shù)難度較大、并發(fā)癥較多，但只有手術(shù)才能根本解決問題。手術(shù)方法有肛瘺瘺管切除、肛瘺瘺管切開，以及掛線，高位肛瘺以及高位復(fù)雜性肛瘺一般采取掛線療法或者部分切除瘺管，部分掛線這種雜交方法同樣可行。 如果病人經(jīng)過多次手術(shù)后仍然復(fù)發(fā)，應(yīng)評估手術(shù)風(fēng)險(xiǎn)，肛門功能情況決定是帶瘺生存還是還是再繼續(xù)手術(shù)。