扁桃體切除是治療部分扁桃體疾病非常重要的手段，扁桃體切除，有時(shí)也會(huì)對(duì)人體造成負(fù)面影響。例如扁桃體由于是咽部最大的淋巴器官，同時(shí)又是咽部淋巴環(huán)的重要組成部分，因此當(dāng)缺失扁桃體后，在咽部的免疫功能就受到影響。病原體會(huì)由于咽部失去保護(hù)作用，而對(duì)下咽部甚至下呼吸道感染，造成下咽部炎癥，或肺炎、支氣管炎等。除此之外，由于扁桃體的表面有大量腺體，其可以分泌黏液及免疫物質(zhì)，當(dāng)扁桃體被切除后，腺體所分泌的黏液和免疫物質(zhì)就自然消失，咽部會(huì)出現(xiàn)明顯的咽干，有時(shí)還會(huì)由于免疫物質(zhì)缺失，而導(dǎo)致咽部長(zhǎng)期的慢性炎癥。因此雖然治療慢性扁桃體炎或扁桃體腫瘤時(shí)，有時(shí)不得已要做扁桃體的切除手術(shù)。然而對(duì)于扁桃體切除術(shù)的手術(shù)方式來(lái)治療疾病，還是要非常慎重，在能夠保存扁桃體的情況下，盡量保留。