早上醒來肚子痛、拉肚子即腹痛、腹瀉，常見原因如下：1、消化系統(tǒng)疾病：患者應適當進行消化系統(tǒng)的檢查，如果有急慢性胃炎、胃腸炎、膽汁反流性胃炎、胃或十二指腸潰瘍，或慢性的胰腺炎、膽囊炎、肝炎、闌尾炎、腹膜炎等疾病，早晨醒來時就經(jīng)常會有腹脹、腹痛、食物吸收消化不良等臨床情況。建議患者到醫(yī)院進行系統(tǒng)全面的檢查，以免出現(xiàn)上述的臨床情況，而疾病遷延不愈合，避免出現(xiàn)炎癥的周身感染，造成代謝紊亂或代謝綜合征。還要到醫(yī)院進行胃鏡、腸鏡，最好做幽門螺桿菌的檢測；2、內(nèi)分泌疾病：易造成胃腸道植物神經(jīng)功能紊亂，包括嚴重的甲狀腺功能亢進、腎上腺功能不全，也會早上醒來腹瀉。